WELCOME MY BLOG :)

Berlian Nur

RSS

Biokimia (Protein)


BIOKIMIA
 
MAKALAH


“PROTEIN”

http://1.bp.blogspot.com/-tJmtc20hm1Y/TaiqLnoEXPI/AAAAAAAAEd0/7AWxqWO3EL0/s1600/Logo-unmul-borneo.jpg







DisusunOleh :
Berlian Nur (1005015014)
 
                                     
                                     
                                                                            
PENDIDIKAN  BIOLOGI
FAKULTAS KEGURUAN DAN ILMU PENDIDIKAN
UNIVERSITAS MULAWARMAN
SAMARINDA
2012
BAB I
PENDAHULUAN

1.1 Latar Belakang
Kebangkitan biokimia diawali dengan penemuan pertama molekul enzimdiastase, pada tahun 1833 oleh Anselme Payen.Tahun 1828Friedrich Wöhler menerbitkan sebuah buku tentang sintesisurea, yang membuktikan bahwa senyawa organik dapat dibuat secara mandiri.Penemuan ini bertolak belakang dengan pemahaman umum pada waktu itu yang meyakini bahwa senyawa organik hanya bisa dibuat oleh organisme.Istilah biokimia pertama kali dikemukakan pada tahun 1903 oleh Karl Neuber, seorang kimiawan Jerman. Sejak saat itu, biokimia semakin berkembang, terutama sejak pertengahan abad ke-20, dengan ditemukannya teknik-teknik baru seperti kromatografidifraksi sinar X, elektroforesis, RMI (nuclear magnetic resonance, NMR), pelabelan radioisotopmikroskop elektron, dan simulasi dinamika molekular. Teknik-teknik ini memungkinkan penemuan dan analisis yang lebih mendalam berbagai molekul dan jalur metabolik sel, seperti glikolisis dan siklus Krebs.Perkembangan ilmu baru seperti bioinformatika juga banyak membantu dalam peramalan dan pemodelan struktur molekul raksasa.
Saat ini, penemuan-penemuan biokimia digunakan di berbagai bidang, mulai dari genetika hingga biologi molekular dan dari pertanian hingga kedokteran.Penerapan biokimia yang pertama kali barangkali adalah dalam pembuatan roti menggunakan khamir, sekitar 5000 tahun yang lalu.
Organisme atau benda hidup, baik yang uniseluler maupun multiseluler dibangun oleh biomolekul yaitu protein, asam nukleat, karbohidrat, dan lipid. Khusus biomolekul protein, pada organisme mana pun, ditemukan identic satu sama lain, tetapi tidak sama. Protein berperan biologis, terutama dalam membangun unit terkecil kehidupan, yaitu sel. Peran biologis itu misalnya pada transformasi energy, bioenergy, dan pada proses dinamisasi yang berkesinambungan.
Kata protein berasal dari protos atau proteos yang berarti pertama atau utama.Protein merupakan komponen penting atau komponen utama sel hewan atau manusia.Oleh karena sel itu merupakan pembentuk tubuh kita, maka protein yang terdapat dalam makanan berfungsi sebagai zat utama dalam pembentukan dan pertumbuhan tubuh. Proses kimia dalam tubuh dapat berlangsung dengan baik, karena adanya enzim, suatu protein yang berfungsi sebagai biokatalis. Kita memperoleh protein dari makanan yang berasal dari hewan atau tumbuhan.Protein yang berasal dari hewan disebut protein hewani, sedangkan yang berasal dari tumbuhan disebut protein nabati.
Beberapa makanan sumber protein ialah daging, telur, susu, ikan, beras, kacang, kedelai, gandum, jagung, dan buah-buahan. Klasifikasi protein berdasarkan daya kelarutannya
1). Albumin : protein yang dapat melarut dalam air, dan dapat dipresipitatkan dari larutan pada konsentrasi garam yang tinggi.
2). Globulin : protein ini umumnya tidak melarut dalam air yang basa, garam, dan dapat melarut dalam larutan garam encer.
3). Glutelin : protein yang tidak melarut dalam larutan netral, retapi melarut dalam asam atau alkali encer.
4). Prolamine : protein yang melarut dalam 70-80% etanol dan tidak melarut dalam air atau etanol absolute.


1.2 Rumusan Masalah
1.      Mengetahui pengertian biokimia dan protein
2.      Mengetahui karakteristik protein
3.      Mengetahui klasifikasi protein
4.      Mengetahui penggolongan protein
5.      Mengetahui sifat-sifat protein
6.      Mengetahui fungsi protein
7.      Mengetahui macam protein majemuk
8.      Mengetahui struktur protein

1.3 Tujuan
1.      Untuk mengetahui pengertian biokimia dan protein
2.      Untuk mengetahui karakteristik protein
3.      Untuk mengetahui klasifikasi protein
4.      Untuk mengetahui penggolongan protein
5.      Untuk mengetahui sifat-sifat protein
6.      Untuk mengetahui fungsi protein
7.      Untuk mengetahui macam protein majemuk
8.      Untuk mengetahui struktur protein

























BAB II
PEMBAHASAN

2.1 Biokimia dan Protein
Biokimia adalah kimiamakhluk hidup. Biokimiawan mempelajari molekul danreaksi kimiaterkatalisis oleh enzim yang berlangsung dalam semua organisme.Biokimia merupakan ilmu yang mempelajari struktur dan fungsi komponen selular, seperti protein, karbohidrat, lipid, asam nukleat, dan biomolekul lainnya. Saat ini biokimia lebih terfokus secara khusus pada kimia reaksi termediasi enzim dan sifat-sifat protein.Saat ini,biokimia metabolisme sel telah banyak dipelajari. Bidang lain dalam biokimia di antaranya sandi genetik (DNA, RNA), sintesis protein, angkutan membran sel, dan transduksi sinyal.
http://files.devoav1997.webnode.com/200047760-eecd8efc83/Biokimia%20Dna.jpg
Kata protein berasal dari protos atau proteos yang berarti pertama atau utama.Protein merupakan komponen penting atau komponen utama sel hewan atau manusia.Oleh karena sel itu merupakan pembentuk tubuh kita, maka protein yang terdapat dalam makanan berfungsi sebagai zat utama dalam pembentukan dan pertumbuhan tubuh. Proses kimia dalam tubuh dapat berlangsung dengan baik, karena adanya enzim, suatu protein yang berfungasi sebagai biokatalis. Kita memperoleh protein dari makanan yang berasal dari hewan atau tumbuhan.Protein yang berasal dari hewan disebut protein hewani, sedangkan yang berasal dari tumbuhan disebut protein nabati.

Beberapa makanan sumber protein ialah daging, telur, susu, ikan, beras, kacang, kedelai, gandum, jagung, dan buah-buahan. Tumbuhan membentuk proten dari CO2, H2O, dan senyawa Nitrogen.Hewan yang memakan tumbuhan mengubah protein nabati menjadi protein hewani.Disamping digunakan untuk pembentukan sel-sel tubuh, protein juga dapat digunakan sebagai sumber energy apabila tubuh kita kekurangan karbohidrat dan lemak. Komposisi rata-rata unsure kimia yang terdapat pada protein ialah sebagai berikut: karbon 50%, Hidrogen 7%, Oksigen 23%, Nitrogen 16%, Belerang 0-3%, dan Fosfor 0-3%. Dengan pedoman pada kadar nitrogen sebesar 16%, dapat dilakukan penentuan kandungan protein dalam suatu bahan makanan.

Nama Bahan Makanan
Kadar Protein (%)
Daging Ayam
18,2
Daging Sapi
18,8
Telur Ayam
12,8
Susu Sapi Segar
3,2
Keju
22,8
Bandeng
20,0
Udang Segar
21,0
Kerang
8,0
Beras Tumbuk Merah
7,9
Beras Giling
6,8
Kacang Ijo
22,2
Kedelai Basah
30,2
Tepung Terigu
8,9
Jagung Kuning (Butir)
7,9
Pisang Ambon
1,2
Durian
2,5

Protein mempunyai molekul besar dengan bobot molekul bervariasi antara 5.000 sampai jutaan. Dengan cara hidrolisis oleh asam atau oleh enzim, protein akan menghasilkan asam-asam amino. Ada protein yang mudah larut dalam air tetapi juga ada yang sukar larut dalam air.Rambut dan kuku adalah suatu protein yang tidak larut dalam air dan tidak mudah bereaksi, sedangkan protein yang terdapat dalam air dan mudah bereaksi.

2.2 Karakteristik Protein
Ø  Protein ikan bersifat tidak stabil dan mempunyai sifat dapat berubah (denaturasi) dengan berubahnya kondisi lingkungan.
Ø  Apabila larutan protein tersebut diasamkan hingga mencapai pH 4,5 – 5 maka akan terjadi pengendapan atau salting out.
Ø  Sebaliknya apabila dipanaskan seperti dalam pemasakan atau penggorengan , protein ikan menggumpal atau terkoagulasi.
Ø  Protein juga dapat mengalami denaturasi apabila dilakukan pengurangan kandungan air, baik selama pengeringan maupun pembekuan.
Ø  Protein otot sebagaian besar dalam bentuk koloid, baik berupa sol maupun gel.
Ø  Kemampuan untuk mengektraksi protein miosoin lewbih besar pda pH yang aghak tinggi, tetapi kekutan gel daging ikan pada produk akhir lebih redah meskipun jumlah myosin yang diekstrak lebih banyak.

2.3 Klasifikasi Protein
Hingga saat ini belum ada klasifikasi protein yang secara umum memuaskan. Klasifikasi protein yang menonjol didasarkan pada antara lain:
Ø  Kelarutan
Ø  Bentuk keseluruhan
Ø  Peranan biologis
Pembagian protein juga dapat dilakukan berdasarkan fungsi dan strukturnya. Berdasarkan fungsinya, protein diklasifikasikan menjadi (i) protein enzim, berperan dalam mempercepat reaksi-reaksi biokimia, (ii) protein sruktural, membentuk struktur-struktur biologis, (iii) protein transpor, berperan sebagai pengangkut subtansi-subtansi penting, dan (iv) protein pertahanan, melindungi tubuh dari invasi benda-benda asing. Berdasarkan strukturnya, protein diklasifikasikan menjadi: (i) protein globular, memi-liki pelipatan-pelipatan
yang kompleks, struktur tertier dengan bentuk yang tidak teratur. Protein serabut, memanjang, lipatan sederhana,umum dijumpai pada protein struktural. Dalam uraian berikut ini hanya dibahas klasifikasi berdasarkan bentuk dan peranan biologisnya.


a. Berdasarkan bentuknya, protein dibagi menjadi :
1) Protein globular
Rantai polipeptida mengandung banyak lipatan dan berbelit.Rasio aksial kurang dari 10, misalnya insulin, albumin, globulin plasma, dan kebanyakan enzim.
2) Protein fibrosa
Rantai polipeptida atau kelompok rantai yang membelit dalam bentuk spiral atau heliks, dan dihubungkan oleh ikatan disulfida dan hidrogen.Rasioaksial lebih besar dari 10, misalnya keratin dan miosin.

b. Ikatan-ikatan pada Struktur Protein
Struktur protein umumnya dipertahankan oleh dua ikatan sangat kuat yaitu ikatan peptida dan ikatan disulfida; dan tiga ikatan yang lemah, yaitu ikatan hidrogen, interaksi hidrofobik dan interaksi elektrostatif.
1) Ikatan peptide 
Ikatan peptida adalah ikatan yang menghubungkan atom a-karboksil dari suatu asam amino dan atom a nitrogen dari asam amino yang lain. Peptida yang dibentuk oleh dua molekul asam
amino disebut dipeptida; bila dibentuk oleh 3 molekul asam amino disebut tripeptida; dan bila dibentuk oleh banyak molekul asam amino disebut polipeptida.

2) Ikatan disulfide
Terbentuk antara 2 residu sistein yang saling berhubungan 2 bagian rantai polipetida melalui residu sistein.

3) Ikatan hydrogen
Terbentuk antara gugus NH- atau -OH dan gugus C=O dalam ikatan peptida atau -COO- dalam gugus R, misalnya dua peptida mungkin membentuk ikatan hidrogen.

4) Interaksi hidrofobik
Rantai samping non polar asam amino netral pada protein cenderung bersekutu.

5) Interaksi elektrostatik
Merupakan ikatan garam antara gugus yang bermuatan berlawanan pada rantai samping asam amino.

    Klasifikasi protein berdasarkan daya kelarutannya
1.      Albumin : protein yang dapat melarut dalam air, dan dapat dipresipitatkan dari larutan pada konsentrasi garam yang tinggi.
2.      Globulin : protein ini umumnya tidak melarut dalam air yang basa, garam, dan dapat melarut dalam larutan garam encer.
3.      Glutelin : protein yang tidak melarut dalam larutan netral, retapi melarut dalam asam atau alkali encer.
4.      Prolamine : protein yang melarut dalam 70-80% etanol dan tidak melarut dalam air atau etanol absolute.

     Klasifikasi protein berdasarkan fungsinya.
1.             Enzim, berfungsi sebagai katalisator reaksi kimia dalam jasad hidup.
2.             Protein pembangunan, berfungsi sebagai unsur pembentuk struktur biologi kekuatan.
3.             Protein kontraktil, berfungsi sebagai protein yang memberikan kemampuan kepada sel dan organism untuk berkontraksi, mengubah bentuk atau gerak.
4.             Protein pengangkut, memiliki kemampuan mengikat molekul tertentu dan melakukan pengangkutan berbagai macam zat melalui aliran darah.
5.             Protein pengatur, yaitu beberapa protein membantu mengatur aktivitas seluler atau fisiologis, diantaranya yaitu hormon.
6.             Protein bersifat racun, yaitu yang dapat menyebabkan keracunan makanan.
7.             Protein pelindung, yaitu protein khusus yang dibuat oleh limposit yang dapat mengenali dan mengendapkan atau menetralkan serangan bakteri, virus atau protein asing dari spesies lain.
8.             Protein cadangan, protein ini disimpan untuk berbagai proses metabolism dalam tubuh.


2.4 Penggolongan protein
Berdasarkan strukturnya protein dapat dibagi dalam 2 golongan besar, yaitu golongan protein sederhana dan protein gabungan.Yang dimaksud dengan protein sederhana ialah protein yang hanya terdiri atas molekul-molekul asam amino.Sedangkan protein gabungan ialah protein yang terdiri atas protein dan gugus bukan protein, gugus ini disebut gugus prostetik dan terdiri ats karbohidrat, lipid, asam nukleat.Proin sederhana dapat dibagi dalam dua bagian menurut bentuk molekulnya yaitu protein biber dan protein globular.Protein fiber mmpunyai molekul panjang seperti serat atau serabut.Sedangkan protein globular berbentuk bulat.
2.4.1        Protein Fiber
Molekul protein ini terdiri atas beberapa rantai polipeptida yang memanjang dan dihubungkan satu dengan yang lain oleh beberapa ikatan silang hingga merupakan bentuk serat atau serabut yang stabil. Struktur protein fiber telah banyak diteliti dengan menggunakan analisis difraksi sinar X. ciri khas protein fiber tedapat pada beberapa jenis protein. Yang termasuk golongan ini adalah antara lain
1.      Konfigurasi alfa helix pada kratin
2.      Lembaran berlipat parallel dan anti parallel pada protein sutra alam; dan
3.      Helix tripel pada kolagen
Sifat umum protein fiber ialah tidak larut dalam air dan sukar diuraikan oleh enzim.Kolagen adalah suatu jenis protein yang terdapat pada jaringan ikat.Kratin adalah protein yang terdapat dalam bulu domba, sutra alam, rambut, kulit, kuku dan sebagainya. Struktur kelatin hamper seluruhnya terdiri atas rantai polipeptida yang berbentuk alfa helix.

2.4.2        Protein Globular
Umunya berbentuk bulat atu elips dan terdiri atas rantai polipeptida yang berlipat.Protein globular pada umunya mempunyai sifat dapat larut dalam air, dalam larutan asam atau basa dan dalam etanol.Beberapa jenis protein globular yaitu albumin, globulin, histon, dan protamin.
http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/3/3d/1GZX_Haemoglobin.png/150px-1GZX_Haemoglobin.png

2.4.3        Protein Gabungan
Yang dimaksud dengan protein gabungan ialah, protein yang berikatan dengan senyawa yang bukan protein.Gugus bukan protein ini disebut gugus prostetik.Ada beberapa jenis protein gabungan antara lain mukoprotein, glikoprotein, lipoprotein, dan nucleoprotein.
Mukoprotein adalah gabungan antara protein dan karbohidrat dengan kadar lebih dari 4% dihitung sebagai heksosamina. Karbohidrat yang terikat ini berupa polisakarida kompleks yang mengandug N-asetilheksosamina bergabung dengan asam uronat atau monosakarida lain. Mukoprotein yang mudah larut terdapat pada bagian putih telur, dalam serum daram dan urin wanita yang sedang hamil.protein ini tidak mudah terdenaturasi oleh panas atau diendapkan oleh zat-zat yang biasanya dapat mengendapkan protein, misalnya triklor asam asetat atau asam pikrat. Glikoprotein adalah juga terdiri atas protein dan karbohidrat, tetapi dengan kadar hexosamina kurang dari 4%.
Lipoprotein adalah gabugan antara protein yang larut dalam air dengan lipid.Lipoprotein terdapat dalam serum darah, dalam otak dan jaringan syaraf.Gugus lipid yang biasanya terikat pada protein dalam lipoprotein antaralain lesitin dan kolesterol.Nucleoprotein terdiri atas protein yang bergabung dengan asam nukleat. Asam nukleat ini terdapat antara lain dalam inti sel.

2.5Sifat-sifat Protein
2.5.1Ionisasi
Protein yang larut dalam air akan membentuk ion yang mempunyai muatan positif dan negative. Dalam suasana asam molekul protein akan membentuk ion positif, sedangkan dalam suasana basa akan membentuk ion negative. Protein mempunyai isolistrik yang berbeda-beda.
2.5.2        Denaturasi
Beberapa jenis protein sangat peka terhadap perubahan lingkungannya.Suatu protein mempunyai arti bagi tubuh apabila protein tersebut di dalam tubuh dapat melakukan aktivitas biokimiawinya yang menunjang kebutuhan hidup.Aktivitas ini banyak tergantung pada struktur dan konformasi molekul protein berubah,misalnya oleh perubahan suhu,Ph atau karena terjadinya suatu reaksi dengan senyawa lain,ion-ion logam,maka aktivitas biokimiawinya akan berkurang.perubahan konformasi alamiah menjadi suatu konformasi yang tidak menentu merupakan suatu proses yang disebut denaturasi.Proses denaturasi ini kadang-kadang dapat berlangsung secara reversible,kadang-kadang tidak.Penggumpalan protein biasanya didahului oleh proses denaturasi yang berlangsung dengan baik pada titik isolistrik protein tersebut.
Protein akan mengalami koagulasi apabila dipanaskan pada suhu 50 atau lebih.


2.5.3        V iskositas
Viskositas adalah tahanan yang timbul aleh adanya gesekan antara molekul-molekul di dalam zat cair yang mengalir.Suatu larutan protein dalam air mempunyai viskositas atau kekentalan yang relative lebih besar daripada viskositas air sebagai pelarutnya.Pada umumnya viskositas suatu larutan tidak ditentukan atau diukur secara absolute, tetapi ditentukan viskositas relatif, yaitu dibandingkan terhadap viskositas zat cair tertentu.Alat yang digunakan untuk menentukan viskositas ini ialah viscometer Oswald.Pengukuran viskositas dengan alat ini didasarkan pada kecepatan aliran suatu zat cair atau larutan melalui pipa tertentu.Serum darah misalnya, mempunyai kecepatan aliran yang lebih lambat dibandingkan dengan kecepatan aliran air.Apabila viskositas air diberi harga satu, maka viskositas serum darah mempunyai harga kira-kira antara 1,5 sampai 2,0. Viskositas larutan protein tergantung pada jenis protein, bentuk molekul, konsentrasi serta larutan.Viskositas berbanding lurus dengan konsentrasi tetapi berbanding terbalik dengan suhu.Larutan suatu protein yang bentuk molekulnya panjang mempunyai viskositas lebih besar daripada larutan suatu protein yang berbentuk bulat.Pada titik isolistrik viskositas larutan protein mempunyai harga terkecil.
2.5.4        Kristalisasi
Banyak protein yang telah dapat diperoleh dalam bentuk Kristal. Meskipun demikian proses kristalisasi untuk berbagai jenis protein tidak selalu sama, artinya ada yang dengan mudah dapat terkristalisasi, tetapi ada pula yang sukar.Beberapa enzim antara pepsin, tripsin, katalase, dan urease telah dapat diperoleh dalam bentuk Kristal. Albumin pada serum atau telur sukar dikristalkan. Proses kristalisasi protein sering dilakukan dengan jalan penambahan garam ammoniumsulfat atau NaCl pada larutan dengan pengaturan pH pada titik isolistriknya. Kadang-kadang dilakukan pula penambahan asetonatau alcohol dalam jumlah tertentu.Pada dasarnya semua usaha yang dilakukan itu dimaksudkan untuk menurunkan kelarutan protein dan ternyata pada titik isolistrik kelarutan protein paling kecil, sehingga mudah dapat dikristalkan dengan baik.

2.5.5        System koloid
Pada tahun 1861 Thomas Graham membagi zat-zat kimia dalam dua kategori, yaitu zat yang dapat menembus membran atau kertas perkamen dan zat yang tidak dapat menembus membran. Oleh karena yang mudah menembus membrane adalah zat yang dapat mengkristal, maka golongan ini disebut kristaloid, sedangkan golongan lain yang tidak dapat menembus membrane disbut koloid. Pengertian koloid pada waktu ii lebih banyak dihubungkan dengan besarnya molekul atau pada bobot molekul yang besar.Molekul yang besar atau molekul makro apabila dilarutkan dalam air mempunyai sifat koloid, yaitu tidak dapat menembus membrane atau kertas perkamen, tetapi tidak cukup besar sehigga tidak dapat mengendap secara alami.System koloid adalah system yang heterogen, terdiri atas dua fase, yaitu partikel keci yang terdispersi dan medium atau pelarutnya.Pada umumnya partiel koloid mempunyai ukuran antara 1 milimikaro-100 milimikro, namun batas ini tidak selalu tetap, mungkin lebih besar.Bobot molekul beberapa protein telah ditentukan berdasarkan kecepatan pengendapan dengan menggunakan ultrasentrifuga yang mempunyai kecepatan putar kira-kira 60.000 putaran per menit.
Bobot Molekul Beberapa Protein
Protein
Bobot Molekul
Sitikrom c
11.600
Ribonuklease
13.500
Tripsin
24.000
Laktoglobulin
35.000
Hemoglobin
64.500
Heksokinase
96.000
Laktat dehidrogenase
150.000
Urease
483.000
Myosin
620.000
Imonoglobulin
960.000
Lipoprotein
3-2  0   juta

Reaksi-reksi khas protein
Reaksi Xantoprotein
Larutan asam nitrat pekat ditambahkan dengan hati-hati kedalam larutan protein. Setelah dicampur terjadi endapat putih yang dapat berubah menjadi kuning apabila dipanaskan.Reaksi yang terjadi ialah nitrasi pada inti benzene yang terdapat pada molekul protein .jadi reaksi ini positif untuk protein yang mengandung tirosin. Fenilanin dan tripotan. Kulit kia bila kena asam nitrat berarna kuning, itu juga karena terjadi reaksi xantoprotein ini.
Reaksi Hopkins-cole
Tripoptan dapat berkondensasi dengan beberapa aldehid denganbantuan asam kuat dan membentuk senyawa yang berawarna .Larutan protein yang mengadung tripoptan dapat di reaksikan dengan pereaksi Hopkins-cole yang mengadung asam glioksilat.
Reaksi Millon
Reaksi millon adalah larutan dan merkuro dan merkuro nitrat dalam asam nitrat. Apabila preaksi ini ditambahkan pada larutan protein, akan menghasilkan endapan putih yang dapat berubah menjadi merah oleh pemanasan. 
Reaksi Nitroprusida
Natriumnitroprosida dalam larutan amoniak akan  menghasilkan warna merah dengan protein yang mempunyai gugus-SH bebas. Jadi protei yang mengandung sistein dapat memberikan hasil positif.Gugus –s-s- pada sistin apabila direduksi dahulu dapat juga memberikan hasil positif.
Reaksi Sakaguchi
Preaksi yang digunakan ialah naftol dan natriumhipobromit.Pada dasarnya reaksi ini memberi hasil positif apabila ada gugus guanidine.Jadi arginin atau protein yang mengandung arginin dapat mnghasilkan warna merah.
Pemurnian protein
Langkah awal dalam pemurnian protein ini ialah menentukan bahan alam yang akan diproses. Penentuan ini didasarkan pada kadar protein yang terkandung didalamnya. Langkah berikutnya ialah mengeluarkan protein dari bahan alam tersebut.

2.6 Fungsi Biologi Protein
Ø    Suatu protein, baik structural dan fungsionalnya, ditentukan oleh susunan atau sekuensi residu asam amino yang menyusunnya. Salah satu tujuan biokimia yang banyak diteliti dan dikerjakan ialah menentukan sekuensi dan residu asam amino yang menyusunnya, karena sekuensi dan residu asam amino inilah yang berperan pada fungsi biologi makromolekul protein. Berikut beberapa makromolekul protein alamiah yang fungsi biologinya sudah diketahui dengan baik.
Ø    Enzim ialah protein yang berfungsi sebagai biokatalis pada reaksi-reaksi metabolism. Semua reaksi metabolism di dalam dan di luar sel dikatalisis oleh enzim. Enzim kerjanya amat spesifik dan “berdisiplin tinggi”. Setiap reaksi metabolisme dimulai dimulai dan dipandu oleh enzim khusus. Sudah diketahui lebih dari 200 enzim yang masing-masing mengakatalitik reaksi yang berbeda.
Ø    Protein transfor ialah protein yang berfungsi sebagai pengangkut dan pembawa molekul atau ion spesifik dan macam-macam gas seperti gas oksigen ke sel lain atau jaringan atau organ yang memerlukannya. Sebaliknya, ia juga mengangkut “limbah” metabolism yang harus dikeluarkan dari jaringan atau organ keluar tubuh/sel. Protein transfor ialah haemoglobin pada cairan darah. Pada plasma darah, ada juga lipoprotein yaitu senyawa lipid-protein yang mengangkut asam lemak, lipid, glukosa, asam amino berupa nutrient yang diperlukan oleh sel.
Ø    Protein penyimpan protein banyak ditemukan pada berbagai biji yang siap tumbuh seperti kecambah. Protein ini dibutuhkan untuk pertumbuhan embrio tumbuhan sebelum tumbuhan tersebut dapat mandiri. Sebagai contoh, protein biji gandum, beras, jagung, dan sebagainya. Pada telur, sebagai persiapan embrio, ditemukan protein ovalbumin dan albumin pada putih telurnya. Susu atau ASI sebagai makanan bayi mengandung kasein, yaitu protein susu. Ferritin ditemukan pada jaringan, yaitu protein yang menyimpan unsur besi.
Ø    Protein motil ialah protein yang ditemukan di dalam sel yang menyebabkan sel yang bersangkutan dapat berubah bentuk dan bergerak sebagai akibat berkontraksinya bagian sitoplasma khusus, karena itu disebut juga protein kontraktil.
Ø    Protein structural, beberapa jaringan atau organ dari suatu organisme dapat kaku sehingga dapat menyangga organisme secara keseluruhan karena beberapa protein structural.
Ø    Protein pertahanan tubuh, ada protein yang berfungsi mempertahankan tubuh organisme terhadap serangan akibat masuknya protein asing atau supramolekul virus atau sel bakteri ke dalam organisme. Imunoglobin adalah protein antibody pada vertebrata yang diproduksi oleh limposit yang dapat menetralisasi dengan cara mengendapkan protein asing tadi sehingga netral.
Ø    Protein pengatur, adalah protein yang mengkoordinasi dan mengatur aktivitas selular secara fisiologi, yaitu hormone, contohnya insulin. Hormone pertumbuhan dari kelenajar pituitary dan paratiroid adalah molekul protein yang mengatur transfor CA2+ dan P pada tingkat seluler. Repressor adalah protein yang mengatur biosintesis enzim pada sel bakteri.
Ø    Monelin, protein yang ditemukan pada tumbuhan di Afrika yang rasanya manis, sedang dipelajari kemungkinan dapat menggantikan glukosa yang berisiko tinggi.
Ø    Protein antibeku, ditemukan pada plasma darah ikan yang hidup di Benua Antartika.
Ø    Protein resilin, ditemukan pada persendian sayap insekta, keistimewaannya ialah memiliki daya elastisitas yang sempurna.


2.7 Protein Majemuk
Protein majemuk adalah protein yang mengandung senyawa bukan protein, senyawa ini disebut gugus prosterik.Protein ini banyak terdapat di alam.
a.       Nucleoprotein
Berlainan dengan nukleohiston, hubungan asam nukleat dengan protein pada nukleatprotein ialah dengan cara ikatan valensi sekunder, bukan antara asam dan basa. Nucleoprotein larut dalam larutan garam isotonic dan didapatkan pada jasad renik.
b.      Glikoprotein
Gugus penggandeng disini ialah karbohidrat.Contoh : musin (pada air liur), oskomukaid (pada tulang), dan tendomukoid (pada tendon).
c.       Fosfoprotein
Fosfoprotein ialah senyawa protein yang mengandung fosfor.Contoh : kasein (pada susu), dan vitelin (pada kuning telur).
d.      Kromoprotein
Termasuk golongan ini ialah protein protein berfigmen yang disebabkan oleh gugus prostestiknya, diantaranya hemoglobin (mengandung protoporfirin besi), seruroplasmin (mengandung Cu), hemosianin (mengandung Cu), asam askorbat oksidase (mengandung Cu), dan ferritin (mengandung Fe).
e.       Protein-koenzim
Contohnya dehigrogenase yakni enzim pengoksidasi yang mengandung gugus prostetik NAD+, NADP+, FMN, dan FAD.
f.       Lipoprotein
Sebagai gugus protestik disini ialah asam lemak, lesitin, atau sefalin. Lipoprotein tidak sama dengan proteolipid, karena lebih sedikit mengandung lipida.
g.      Metaloprotein
Protein yang mengandung unsur-unsur anorganik seperti Fe, Co, Mn, Zn, Cu, Mg, dan sebagainya.Logam-logam ini penting bagi protein-protein tertentu dan banyak enzim tergolong dalam metaloprotein ini.


2.8 Struktur Protein
        Protein mempunyai struktur yang sangat kompleks.  Struktur protein memegang peranan penting dalam menentukan aktivitas biologisnya.Struktur protein terdiri dari empat tingkatan, yaitu struktur primer, sekunder, tersier, dan kuartener. 
Struktur primer

                       
Struktur primer merupakan urutan asam amino dalam struktur protein yang dihasilkan dari ikatan kovalen antar asam amino dalam rantai (ikatan peptida).  Sifat kovalen pada ikatan peptida     stabil, tidak dipengaruhi oleh pH dan  pelarut.

http://4.bp.blogspot.com/-539mCirEIog/TZRJtcFxkvI/AAAAAAAAAAk/kiD4ojGDU6U/s320/Protein_-_Primary_Structure-w3-hwdsb-on-ca.jpg

 
2.8.1 Struktur Sekunder
         Kekuatan menarik di antara asam amino dalam rangkaian protein menyebabkan struktur utama (primer) membelit, melingkar, dan melipat diri sendiri.Bentuk-bentuk yang dihasilkan dapat spiral, heliks, dan lembaran.Bentuk ini dinamakan bentuk struktur sekunder. Struktur sekunder dikukuhkan oleh ikatan hidrogen.Struktur sekunder protein yang merupakan konformasi rantai polipeptidanya terdiri dari:
α-heliks
α-heliks terbentuk karena adanya ikatan hidrogen antara atom O pada gugus CO dengan atom H pada gugus NH (ditandai dengan garis warna oranye). α-heliks berupa pilinan rantai asam amino yang menggulung berbentuk seperti spiral.
β-pleated sheet
Struktur β-pleated sheet juga terbentuk karena adanya ikatan hidrogen. Namun seperti terlihat pada gambar, ikatan hidrogen terjadi antara atom H pada gugus NH (ikatan peptida) dengan atom O (oksigen karbonil) pada gugus ikatan peptida lain dalam rantai peptida yang tidak sama. Sehingga membentuk seperti lembaran kertas yang berlipat-lipat.



 2.8.2  Struktur Tersier

                         Struktur tersier terjadi karena pelipatan struktur sekunder akibat adanya interaksi antar gugus alkil (R) satu sama lain, yaitu interaksi hidrofobik, ionik, ikatan hidrogen, gaya dispersi van der waals dan jembatan disulfida. Sehingga, membentuk struktur tiga dimensi.Struktur tersier dikukuhkan oleh berbagai jenis ikatan seperti jembatan garam, ikatan disulfida, dan interaksi hidrofobik.

http://4.bp.blogspot.com/-2niEG-Kxz_M/TZRLiGSTGtI/AAAAAAAAAAw/U1N_OI_w28s/s320/Protein-Struktur-Tersier.jpg


            



2.8.3 Struktur Kuartener

      Merupakan protein atau polipeptida yang sudah memiliki struktur tersier yang dapat saling berinteraksi dan bergabung menjadi suatu multimer.Protein pembentuk multimer dinamakan subunit.Jika suatu multimer dinamakan dimer jika terdiri atas 2 subunit, trimer jika 3 subunit dan tetramer untuk 4 subunit.Multimer yang terbentuk dari subunit-subunit identik disebut dengan awalan homo–, sedangkan jika subunitnya berbeda-beda dinamakan hetero–.Misalnya hemoglobin yang terdiri atas 2 subunit alfa dan 2 subunit beta dinamakan heterotetramer. Beberapa protein dapat berfungsi sebagai monomer, sehingga ia tidak memiliki struktur kuartener.


http://1.bp.blogspot.com/-tjbmi32e5NM/TZRNNuS8cAI/AAAAAAAAAA0/aPrAWXFwZ1A/s320/kuartener.jpg








BAB III
KESIMPULAN DAN SARAN
3.1  Kesimpulan
1.      Biokimia merupakan ilmu yang mempelajari struktur dan fungsi komponen selular, seperti protein, karbohidrat, lipid, asam nukleat, dan biomolekulkondisi lingkungan.
2.      Berdasarkan bentuknya, protein dibagi menjadi :
1) Protein globular
2) Protein fibrosa
3.      protein merupakan senyawakomponen utama a sebagai penyusun sel tubuh mahluk hidup, yang dimana protrin tersebut jugatersusun atas senyawa berupa asam amino. Kemudian, dari asam amino tersebut tersusun atasikatan peptida yang terdiri atas tiga gugus molekul yakni basa punin dan pinidimin. Dan dari pembahasan tadi dapat di ketahui tentang struktur, penggolongan maupunmanfaat senyawa protein bagi tubuh, serta reaksi kimianya yang berlangsung dalam tubuh
4.      Beberapa makanan sumber protein ialah daging, telur, susu, ikan, beras, kacang, kedelai, gandum, jagung, dan buah-buahan.

3.2  Saran
Protein merupakan komponen penting atau komponen utama sel hewan atau manusia. Oleh karena sel itu merupakan pembentuk tubuh kita, maka protein yang terdapat dalam makanan berfungsi sebagai zat utama dalam pembentukan dan pertumbuhan tubuh,jadi banyak-banyaklah mengonsumsi protein.








  • Digg
  • Del.icio.us
  • StumbleUpon
  • Reddit
  • RSS

0 komentar:

Poskan Komentar